Sáng cùng ngày, tàu Việt Phú 16 đang di chuyển trên biển theo hành trình từ TP Hải Phòng đi Chu Lai, huyện Núi Thành, Quảng Nam. Khi đến tọa độ 15,54 độ vĩ bắc - 108,30 độ kinh đông, cách Hòn Tai, đảo Cù Lao Chàm thuộc xã Tam Hiệp, TP Hội An khoảng 200 m về hướng Tây thì bất ngờ thủng đáy, nước tràn vào tàu và nguy cơ bị chìm.
Nhận được thông tin, Đồn biên phòng Cù Lao Chàm đã điều ca nô cùng 8 cán bộ, chiến sĩ tiếp cận tàu và hướng dẫn di chuyển vào khu vực cách Bãi Ông khoảng 700 m về hướng Tây Nam để khắc phục sự cố.
Sau khi thợ lặn xuống kiểm tra, phát hiện phía dưới 2 khoang hàng và phía đầu mũi bị rách. Đồn Biên phòng Cù Lao Chàm đã thông báo Khu bảo tồn biển Cù Lao Chàm và tạo điều kiện cho thợ lặn địa phương ra khắc phục sự cố.
Lúc xảy ra sự cố, trên tàu có 5.000 lít dầu nên Bộ Chỉ huy Bộ đội Biên phòng tỉnh Quảng Nam đã điều động 15 cán bộ, chiến sĩ và 2 tàu của Hải đội 2 cùng với Đồn Biên phòng Cù Lao Chàm hỗ trợ tàu bị nạn và sẵn sàng ứng phó sự cố tràn dầu trên biển.
Theo cơ quan chức năng, tàu Việt Phú 16 có 10 thuyền viên, do ông Đặng Văn Chức (48 tuổi) trú huyện Hoằng Hóa, tỉnh Thanh Hóa làm thuyền trưởng. Trên tàu chở hơn 2.329 tấn xi măng.