Nhạc sĩ Tôn Thất Lập từng đảm nhận các chức vụ: Phó Tổng Thư ký Hội âm nhạc TPHCM khóa III, IV; Phó Chủ tịch Hội âm nhạc TPHCM khóa V; Chủ tịch Hội đồng Nghệ thuật Hội âm nhạc TPHCM khóa VI; Ủy viên Ban Chấp hành Hội Nhạc sĩ Việt Nam các khóa III, IV, V, VI và VII; Phó Tổng Thư ký khóa VI, Phó Chủ tịch khóa VII; Tổng biên tập Tạp chí âm nhạc Việt Nam (Hội Nhạc sĩ Việt Nam).
Thập niên 1960, nhạc sĩ Tôn Thất Lập hoạt động âm nhạc trong phong trào "Hát cho đồng bào tôi nghe". Khi ấy, những ca khúc như Hát cho dân tôi nghe, Xuống đường, hợp xướng Lúa reo trên khắp đồng bằng... của ông cất cao trên các nẻo đường tranh đấu của học sinh, sinh viên đô thị miền Nam.
Sau chiến tranh, ông công tác tại Sở Văn hóa - Thông tin TPHCM. Nhiều ca khúc của ông được đông đảo khán giả mến mộ như: Tình ca mùa xuân, Tình ca tuổi trẻ, Trị An âm vang mùa xuân, Mưa thì thầm, Cô bé dễ thương, Tình yêu mãi mãi…
Nhạc sĩ Tôn Thất Lập được tặng Giải thưởng Nhà nước về Văn học Nghệ thuật đợt II (2007).