Trong 12 năm chung sống, Huy Khánh và Mạc Anh Thư có một con gái. Hiện, nữ người mẫu và con gái sống tại Phần Lan, trong khi diễn viên "Dốc tình" hoạt động nghệ thuật tại Việt Nam.
Huy Khánh cho biết vợ chồng anh vẫn chung sống, nhưng do Mạc Anh Thư đưa con sang Phần Lan du học nên ít có cơ hội gặp. Nam diễn viên liên lạc gia đình vào buổi tối (giờ Việt Nam) do lệch múi giờ.