Ngày 20/9, trả lời PV VTC News, Trung tướng Tô Ân Xô, Chánh Văn phòng, Người phát ngôn Bộ Công an cho biết, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an đã khởi tố bị can, ra lệnh bắt bị can để tạm giam, lệnh khám xét chỗ ở và nơi làm việc đối với Nguyễn Thanh Hải (sinh năm 1971 tại Hà Nội; nghề nghiệp: Vụ trưởng Vụ Quan hệ quốc tế, Văn phòng Chính phủ) về tội "Nhận hối lộ", quy định tại Điều 354 Bộ luật Hình sự.
Sau khi Viện Kiểm sát Nhân dân tối cao phê chuẩn, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an đã thực hiện tống đạt Quyết định khởi tố bị can, thi hành Lệnh bắt bị can để tạm giam, khám xét chỗ ở và nơi làm việc đối với bị can trên.
Cơ quan An ninh điều tra, Bộ Công an đang điều tra mở rộng vụ án để xử lý nghiêm theo quy định của pháp luật.
Cuối tháng 1, Bộ Công an khởi tố bà Nguyễn Thị Hương Lan (Cục trưởng Cục Lãnh sự), Đỗ Hoàng Tùng (Phó cục trưởng đơn vị này), Lê Tuấn Anh (Chánh văn phòng của Cục Lãnh sự) và Lưu Tuấn Dũng (Phó phòng Bảo hộ công dân) về tội "Nhận hối lộ".
Ngày 25/3, Bộ Công an khởi tố bị can, tạm giam Hoàng Diệu Mơ (Tổng giám đốc Công ty TNHH thương mại du lịch và dịch vụ hàng không An Bình) về tội "Đưa hối lộ".
Đến ngày 14/4, Bộ Công an đã khởi tố bị can, bắt giam ông Tô Anh Dũng (Thứ trưởng Bộ Ngoại giao), Phạm Trung Kiên (chuyên viên Vụ Trang thiết bị và Công trình y tế thuộc Bộ Y tế) và ông Vũ Anh Tuấn (cựu cán bộ Cục Quản lý Xuất nhập cảnh, Bộ Công an) về cùng tội danh trên.
Tiếp đó, ngày 25/7, nhà chức trách khởi tố ông Trần Văn Dự (cựu Phó cục trưởng Quản lý Xuất nhập cảnh, Bộ Công an), Nguyễn Mai Anh (chuyên viên Vụ Quan hệ quốc tế Văn phòng Chính phủ), Ngô Quang Tuấn (chuyên viên Vụ Hợp tác quốc tế Bộ GTVT), Vũ Sỹ Cường (cựu cán bộ Cục Quản lý Xuất nhập cảnh) cùng về tội "Nhận hối lộ".
Bị can Bùi Huy Hoàng (cán bộ Cục Y tế dự phòng Bộ Y tế) bị khởi tố về tội Lừa đảo chiếm đoạt tài sản. Người còn lại là Nguyễn Tiến Mạnh (Phó giám đốc Công ty CP du lịch thương mại Lữ Hành Việt, Giám đốc Công ty vận tải du lịch Hoàng Long Luxury) bị khởi tố tội "Đưa hối lộ".
Ngày 18/8, Cơ quan An ninh điều tra Bộ Công an tiếp tục khởi tố bị can, lệnh bắt bị can để tạm giam, lệnh khám xét chỗ ở, nơi làm việc đối với ông Nguyễn Tiến Thân, sinh năm 1980, chuyên viên Vụ Quan hệ quốc tế (Văn phòng Chính phủ) về tội “Nhận hối lộ”
Tại họp báo Chính phủ thường kỳ chiều 4/6, Trung tướng Tô Ân Xô, Chánh văn phòng, Người phát ngôn Bộ Công an, nhấn mạnh đối với vụ án tại Cục Lãnh sự, kết quả điều tra làm rõ sau khi trừ các chi phí, các bị can đã trục lợi mỗi chuyến bay hàng tỷ đồng.